1956年8月，本校改制為「臺灣省立成功大學」，同時增設文理學院(設中國文學、數學、物理等三學系)，1969年10月，文理學院奉准分設文學院、理學院，本院遂正式成立。1971年，本校改制為「國立成功大學」，本院遂正式名為「國立成功大學理學院」。
歷任院長名錄：
文理學院時期(1956-1969)：
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時間 |
院長 |
副院長 |
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1957.08－1958.01 |
張 丹 |
－ |
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1958.02－1968.07 |
吳仁民 |
－ |
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1968.08－1969.07 |
田明朋 |
－ |
理學院成立後(1969-迄今)：
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時間 |
院長 |
副院長 |
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1969.08－1970.07 |
(1) 田明朋 |
－ |
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1970.08－1971.08 |
(2) 張桐生 |
－ |
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1971.09－1972.07 |
李立聰代院長 |
－ |
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1972.08－1976.07 |
(3) 張桐生 |
－ |
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1976.08－1983.07 |
(4-5) 王立均 |
－ |
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1983.08－7989.07 |
(6-7) 田憲儒 |
－ |
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1989.08－1995.07 |
(8-9) 李育嘉 |
－ |
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1995.08－2001.01 |
(10-11) 李羅權 |
－ |
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2001.02－2001.06 |
余樹楨代院長 |
－ |
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2001.07－2007.07 |
(12-13) 余樹楨 |
－ |
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2007.08－2013.07 |
(14-15) 傅永貴 |
柯文峰 |
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2013.08－2016.07 |
(16) 柯文峰 |
陳淑慧 |
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2016.08 - 2019.07 |
(17) 陳淑慧 |
許瑞榮 |
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2019.08－2022.07 |
(18) 陳淑慧 |
張為民 |
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2022.08－迄今 |
(19) 蔡錦俊 |
李欣縈 |
*當院老師人數達六十人以上時，校方條文同意可增設副院長一職。